近日,雷锋网《医健AI掘金志》以“AI制药·下一个现象级赛道”为主题,邀请百图生科、剂泰医药、未知君、望石智慧、英矽智能、星药科技六家先锋企业,举办了一场线上云峰会。
作为此次活动的演讲嘉宾,未知君首席生信科学家胡函以《AI赋能下的肠道微生态药物临床研究》为题,进行了演讲。
胡函表示:“现如今,肠道微生物药物的认可度已经越来越高,国际顶级药企纷纷布局,相比于大家已知的小分子及大分子药物,其有着安全性高、研发周期短、适用性广等多种优点。”
以安全性为例,因为肠道微生物药物都是人体肠道内共生菌,这种共生关系是在长期进化过程中形成,药物安全性得到了进化检验。
虽然具有多种临床优点,但肠道微生物药物真正的最后落地,还面临人工对菌种测试手段有限和求解周期过长等问题。
人体肠道大约有至个菌种,在其中寻找特定菌种组合,运算量将是天文数字,超出人类极限,而且随着菌种数量增加,难度、耗时、耗费也呈指数上升。
在此背景下,人工智能+高通量筛选手段,能够以数据+算法方式,革命性提升微生态制药速度。
目前,未知君以组学数据为基础,已经研发出AI+数据驱动和生物计算的六大跨组学平台。
其中主要以多组学计算平台为基础,采集肠道菌16S、宏基因组、代谢组数据以及宿主代谢组、免疫组数据,并通过提取数据关键信息。
将这些数据在机器学习和生信分析工具实现菌群亚型监测,降维分析和表型关联分析,找出可以进行下一步实验验证的合适菌群。
以下是演讲全部内容,《医健AI掘金志》做了不改变原意的整理和编辑:
深圳未知君生物科技成立于年11月,是国内首家专注于肠道微生态的AI制药公司,旨在通过粪便移植、配方菌等微生物治疗方式,实现肠道及其他系统性疾病的缓解或治疗。
肠道微生物赛道简介肠道微生物是一个较新的研究领域,肠道微生物组被认为是人体的第二个基因组。
肠道微生物中,无论是细胞数目、基因数目,还是可成药靶点数目都远远大于人体。
它们与人体内机体功能有着密切关系,例如免疫作用、代谢作用、神经调控作用等等。
除此之外,肠道微生物还能起到调节人体微生态作用,这都为肠道微生物领域药物开发提供了广阔的前景。
肠道微生物药物开发,引领了整个药物开发进入一个崭新时代,相较于传统小分子、大分子药物,肠道微生物药物具有这样一系列特点:
首先,肠道微生物药物的安全性更高,这是因为肠道微生物药物来源于人体肠道内共生菌。
这种共生关系是在长期进化过程中形成,药物安全性得到了进化过程检验,因此在安全性上要优于人工合成小分子及大分子药物。
其次,肠道微生物药物的研发周期更短。
肠道微生物药物研发突破了固有靶点限制和研发路径,能够直接基于人体数据进行开发,因此在研发周期上有别于传统药物。
再者,肠道微生物药物能够适用更加广泛的适应症。
一方面,肠道微生物与人体内的多个器官、系统稳态都息息相关,更与50多种疾病和肠道微生物失调相关;
另一方面,微生态药物能够通过多种途径产生综合效应,所以它能够适用更广泛适应症。
所以肠道微生物药物开发,将引领着整个药物开发进入一个崭新时代。
年到年,肠道微生物相关研究文献数量快速增长,关于肠道微生物治疗手段相关临床研究注册数量也快速增长。
在此背景下,很多国际药企都积极加入肠道微生态制药当中,与肠道微生态制药企业进行绑定,针对具体适应症进行药物开发。
未知君在阿尔兹海默症治疗研究上,就与日本大型药企卫材进行数据方面合作,在关于肾脏疾病上,也与国内三生制药达成合作,这反映了整个肠道微生态药企和国际大型药企合作已成为一大趋势。
统计数据发现,这些合作模式是多种多样的,既可以体现在细节,例如在单菌、配方菌,以及菌相关小分子合作,也可以体现在药物开发,生产制造等方面合作。
从不同临床阶段分布上,我们可以发现微生物药企与国际药企之间合作大部分集中在早期发现以及临床前阶段。
当然,临床二期和三期也有不少合作案例,例如微生物组学新锐FinchTherapeutics与武田(Takeda),ASMB与艾尔建(Allergan)之间的合作。
这些都属于临床前试验阶段(Pre-Clinical)阶段配方菌相关商业合作,这也是未知君重点